致病钩端螺旋体特异消减片段的序列测定与分析

摘要：

对24个已鉴定的赖型致病钩端螺旋体特异消减片段进行DNA序列测定和生物信息学分析.结果显示,片段两端皆含有Alu Ⅰ酶切位点,片段大小为149～1 506 bp,平均480 bp,GC含量平均为36.63%.其中6个序列无任何同源匹配序列,提示可能来自新基因;18个同源序列可分为两类:与外膜蛋白或假想蛋白相关,与生化代谢修饰相关的酶.在Genbank中登记其中20个序列,序列号分别为AF300873-AF300877,AF325807-AF325821.这些基于生物信息学的功能预测,将有助于在此基础上进行相关的基因克隆鉴定、表达分析及功能验证.

关键词：钩端螺旋体、差异消减片段、序列测定、生物信息学

所属期刊栏目：29

分类号：R377+.5(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金30070670;重庆市应用基础研究基金2002-7481

在线出版日期：2004-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：434-438