基于ISSR标记的多花黑麦草附球菌遗传多样性分析

摘要：

[目的]附球菌(Epicoccum)引起的叶斑病在多花黑麦草上普遍发生,本文探究西南不同地理来源附球菌菌株的遗传差异性和亲缘关系.[方法]以贵州花溪、重庆南川和合川、云南曲靖、四川崇州5个地区获得的37株代表性Epicoccum菌株为材料,利用真菌基因组DNA提取试剂盒提取供试菌株的基因组DNA;用35条ISSR引物对不同地理来源的8株菌株进行预扩增,之后选用其中扩增条带数多的引物对所有参试菌株进行扩增,将数据整理成0、1矩阵,利用NTSYSpc(Version 2.10e)、PopGene(Version 1.32)和GenAIEx6.51软件分别进行聚类分析和主成分分析.[结果]35条ISSR引物中,有6条多态性丰富,条带清晰;供试6条引物共扩增出63条多态性条带,多态性比例为100％.菌株间的遗传相似系数为0.3100～0.9300.当遗传相似系数为0.4180时,37株Epicoccum被划分为5个类群.5个居群的平均遗传一致度(IN)和平均遗传距离(D)分别为0.9168和0.0871,37株供试菌株的平均基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(I)分别为0.3628和0.5388,均高于5个居群的平均值(0.3121和0.4606),相对应的遗传分化系数(Gst)为0.1289,基因流值(Nm)为3.3794.[结论]从聚类分析结果可知ISSR类群划分与菌种分类之间存在一定相关性,不同地理来源的菌株之间遗传相似性较高;主成分分析(PCoA)结果表明遗传多样性与菌株的地理来源不存在明显相关性.

关键词：多花黑麦草、附球菌、ISSR、遗传多样性

所属期刊栏目：36

分类号：S432.1(病虫害及其防治)

资助基金：双一流建设经费-队伍建设经费-科研启动经费;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目;国家重点研发计划

在线出版日期：2023-11-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1934-1941