奶牛乳房炎相关IRF5基因CDS区克隆及表达分析

摘要：

[目的]研究奶牛干扰素调节因子5(Interferon regulatory factor 5,IRF5)基因在奶牛乳腺组织及乳腺上皮细胞炎症中的表达模式.[方法]利用RT-PCR和测序技术克隆得到IRF5基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并采用生物信息学方法分析IRF5基因及其特性;利用qPCR技术检测IRF5基因及相关干扰素调节因子3(Interferon regulatory factor 3,IRF3)和MyD88基因的表达量.[结果]IRF5基因的CDS长度为1500 bp,编码499个氨基酸,存在47个潜在磷酸化位点,氨基酸组成中脯氨酸(Pro)和亮氨酸(Leu)所占比例较高.IRF5蛋白分子式为C2524H3901N671O728S20,主要存在于细胞核和线粒体,理论等电点为5.38,是碱性亲水且不稳定的非分泌蛋白.蛋白互作分析结果显示,IRF5蛋白可能与骨髓分化初级反应蛋白(MyD88)、白细胞介素-1受体相关激酶1(IRAK1)、C-C基序趋化因子4(CCI4)、组蛋白乙酰转移酶p300(EP300)和核受体共激活因子3异构体Xl(NCOA3)等蛋白相互作用,与机体或细胞的炎症反应有关.qPCR结果表明,与健康奶牛相比,IRF5基因在乳房炎奶牛的乳腺组织中的表达量极显著上调(P＜0.01).在乳腺上皮细胞中,与对照组(0 h)相比,IRF5及其相关的Myd88和IRF3基因在LPS诱导乳腺上皮细胞炎症反应的3、6和12 h的表达量均极显著上调(P＜0.01).[结论]IRF5基因在奶牛乳房炎过程中表达量上调,可能通过上述基因参与促进奶牛乳房炎症反应.

关键词：奶牛、乳房炎、IRF5基因、生物信息学分析、基因表达、乳腺上皮细胞

所属期刊栏目：36

分类号：S823(家畜)

资助基金：宁夏自然科学基金项目;宁夏高等学校科学研究项目

在线出版日期：2023-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1097-1104