小麦不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白预测及对比研究

摘要：

[目的]通过对小麦3种不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白进行找寻及性质对比分析,为进一步找寻新型农药作用靶标奠定理论基础.[方法]选择已经公布全基因组序列的3种小麦营养型病原真菌,基于GPCR蛋白所具有的7重跨膜结构典型特征,利用3种蛋白跨膜在线预测程序(TOPCONS、TMHMM、Philius)对上述病原真菌的候选GPCR蛋白开展找寻,以及候选GPCR蛋白序列长度、理论等电点、不稳定系数、最强亲(疏)水性残基等特征和遗传关系进行对比分析.[结果]小麦白粉病菌、叶枯病菌、叶斑病菌中分别含有候选GPCR蛋白11、32、69个,蛋白序列平均长度为396 aa.蛋白的理论等电点平均值在8.78左右,不稳定系数在40左右,亲水性在-2.70左右,疏水性在3.20左右,而最强亲(疏)水性氨基酸残基分布不一致.上述112个候选GPCR蛋白按遗传关系聚为三大类,分别具有71、36、5个蛋白.[结论]小麦不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白数量以活体型真菌数量最少,死体型真菌数量最多,半活体型真菌介于两者之间.不同候选GPCR蛋白在理论等电点、不稳定系数等理化性质及遗传关系等方面具有一定同质性特征,然而最强亲(疏)水性氨基酸残基具有较大差异.

关键词：小麦、白粉病菌、叶枯病菌、叶斑病菌、GPCR蛋白

所属期刊栏目：36

分类号：S512(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金;云南省兴滇英才支持计划;云南省教育厅科学研究基金项目

在线出版日期：2023-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：952-957