10.16213/j.cnki.scjas.2023.5.003
西伯利亚杏全基因组CBF基因家族鉴定及低温胁迫下的表达模式
[目的]利用西伯利亚杏全基因组数据库鉴定CBF家族成员,并分析CBF转录因子保守域特点与功能及其在低温胁迫下的表达情况.[方法]根据西伯利亚杏全基因组数据库,利用BLASTP和HMM Search搜索西伯利亚杏CBF基因,通过CDD和MEME验证其保守结构域.使用Prot-Param、WOLF PSORT、MAGA X、Phyre2、PlantCARE等生物信息学工具分别分析蛋白理化性质、亚细胞定位、系统发育、蛋白三级结构、染色体定位及顺式调控元件.利用实时荧光定量PCR分析西伯利亚杏CBF基因在低温胁迫后的表达模式.[结果]本研究共鉴定出4个西伯利亚杏CBF基因,它们均具有AP2基因家族保守结构域PKKPAGR和DSAWR序列.西伯利亚杏CBF蛋白包含206～246个氨基酸,蛋白理论分子量平均值为25.80 KDa,平均等电点为5.92.PsCBF3和PsCBF4在基因结构上较为相似,亲缘关系更近.4个PsCBFs亚细胞定位均位于细胞核内.启动子顺式作用元件分析结果显示CBF家族成员可参与植物激素和非生物胁迫响应.西伯利亚杏CBF成员均属于酸性和亲水性蛋白.低温胁迫后,CBF基因主要在早期(15 min)表达量较高.[结论]本研究提供了较为完整的西伯利亚杏CBF基因家族信息,为了解PsCBF在西伯利亚杏低温胁迫多个时期的复杂机制和途径提供了新的依据,为进一步研究CBF家族成员的生物学功能奠定了重要的理论基础.
西伯利亚杏、CBF基因家族、生物信息学、低温胁迫
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S662.2(果树园艺)
国家重点研发计划;辽宁省教育厅重点攻关项目;辽宁省科技厅博士启动基金
2023-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
913-923
