整合宏基因组学分析生猪养殖粪污发酵过程中耐药基因的动态变化

摘要：

[目的]探究生猪养殖粪污在堆肥过程中耐药基因的消减规律.[方法]以猪粪和菌渣为发酵原料,进行有氧堆肥处理,在堆肥第1、4、8、12、16、22、29 天,进行上、中、下分层多点采样,提取总DNA构建文库,经定量和检测合格后,进行宏基因组测序分析.通过宏基因组学方法对堆肥过程中耐药基因的动态变化进行分析.[结果]堆肥期间共发现613 个耐药基因,分别对32 类抗生素产生耐药.其中,丰度较高的抗生素分别为青霉烷类抗生素(Penam)、头孢菌素类抗生素(Cephalosporin)、氨基糖苷类抗生素(Aminoglycoside antibiotic)、磷霉素类抗生素(Fosfomycin)、糖肽类抗生素(Glycopeptide antibiotic)和四环素类抗生素(Tetracycline antibiotic),这与现实中常用的抗生素种类相吻合.分析发现耐药基因的消减出现2 个峰值,第一个峰值出现在试验起始时,在第4天迅速下降,然后在第12 天(对照组)和第8 天(实验组)达到第二个峰值,随着细菌的自然凋亡,耐药基因的丰度又下降到低值,慢慢消减下去.[结论]在堆肥过程中,生猪养殖粪污中耐药基因丰度呈现波动式消减.

关键词：宏基因组学、粪污、发酵、耐药基因

所属期刊栏目：36

分类号：S19(农业生产环境保护)

资助基金：中央引导地方科技发展专项;现代农业产业技术体系;四川省科技计划重点研发项目;四川省财政运行专项

在线出版日期：2023-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：655-664