不同禾本科作物中ZmWRKY79同源基因的鉴定与分析

摘要：

[目的]玉米ZmWRKY79 基因在合成植保素和干旱胁迫响应中发挥重要作用.文章旨在通过生物信息学技术从不同禾本科作物中挖掘更多的ZmWRKY79 同源基因,为玉米及其它禾本科作物提供抗逆境胁迫的候选基因.[方法]从NCBI数据库中获取玉米ZmWRKY79 同源基因的基本信息,并对其进行染色体定位、基因结构可视化、功能结构域预测、进化关系分析、亚细胞定位预测、启动子顺式作用元件预测及非生物胁迫表达预测.[结果]在玉米、谷子、高粱、青稞、野生二粒小麦、普通小麦、水稻作物中共鉴定到9 个ZmWRKY79 同源基因,这些基因结构相似性较高,分布于不同的染色体上,且均属于第Ⅲ类WRKY转录因子.系统进化分析结果显示ZmWRKY79 蛋白同源序列可被分为I和Ⅱ类,不同成员间进化受纯化选择,其中ZmWRKY79 蛋白与高粱Sb-WRKY54 蛋白同源性较高,达到81.58％.亚细胞定位预测显示所有ZmWRKY79 同源蛋白均在细胞核,说明ZmWRKY79 同源基因均在细胞核中发挥功能.启动子顺式作用元件预测显示ZmWRKY79 同源基因的启动中主要包含组织特异性元件、应激响应元件和激素响应元件.非生物胁迫表达预测表明,ZmWRKY53 和ZmWRKY742 个ZmWRKY79 的同源基因被确定为受逆境胁迫诱导.[结论]在7 种禾本科作物中鉴定到9 个ZmWRKY79 同源基因,这些同源基因可能具有抗逆功能,为禾本科作物抗逆研究提供了更多的基因选择.

关键词：玉米、ZmWRKY79、同源基因、生物信息学

所属期刊栏目：36

分类号：S513(禾谷类作物)

资助基金：云南省颜龙安院士专家工作站;云南省基础研究专项面上项目;云南省基础研究专项面上项目;云南省科技人才;平台计划项目;平台计划项目

在线出版日期：2023-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：522-531