低温胁迫下野生马齿苋转录组分析

摘要：

[目的]探讨马齿苋低温胁迫的机制,对低温胁迫下野生马齿苋转录本差异进行分析.[方法]马齿苋幼苗采用低温(白天10℃、14 h,晚上5℃、10 h)和适温(白天30℃、14 h,晚上25℃、10 h)处理14 d后,利用二代(RNA-Seq)和三代(Iso-Seq)转录组测序技术探讨适温处理和低温胁迫处理马齿苋的转录本差异.[结果]每个样本平均获得的干净片段为45 397 055,平均GC含量为47.48％,平均Q20和Q30分别为97.7％和93.29％.适温和低温胁迫相比共有26 621个差异表达基因(DEGs),上调的DEGs为12 045个,下调的DEGs为14 576个.GO分析发现适温和低温胁迫相比,马齿苋上调对各种光反应、叶绿素合成和光保护的基因数目显著高于其下调的基因数,而下调丙酮酸磷酸双激酶活性、金属离子转运、调节碳水化合物代谢过程和光系统反应中心I等方面基因的数目显著高于上调的基因数目;KEGG富集差异分析表明蛋白酶体、真核生物核糖体生物发生、昼夜近似节律、萜类主链生物合成及苯环氨基酸生物合成等富集丰富.[结论]GO分析暗示低温胁迫下,马齿苋明显增加了丙酮酸磷酸双激酶活性基因数目,该酶催化CO2受体磷酸烯醇式丙酮酸的再生,从而增加CO2受体的含量;但明显下调了对各种光反应、叶绿素合成的基因数目,暗示低温胁迫显著影响了马齿苋的光合作用.该研究结果可为马齿苋低温胁迫的分子机制研究提供参考.

关键词：马齿苋、低温胁迫、差异表达基因、转录组测序

所属期刊栏目：35

分类号：S58(野生植物)

资助基金：安徽科技学院稳定人才项目;安徽省自然科学基金计划项目;安徽省创新训练项目;安徽省创新训练项目;安徽科技学院创业创新项目

在线出版日期：2023-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2732-2738