青花菜Whirly基因的克隆、系统进化及表达特征分析

摘要：

[目的]克隆青花菜Whirly基因,并分析其序列特征和表达模式,为进一步深入研究其渍水胁迫响应机制及其生物学功能奠定基础.[方法]以"KU20-7"为材料,利用RT-PCR技术克隆得到青花菜Whirly基因,并对其分子量、等电点和二级结构进行分析.利用软件MEGA 6.0对部分植物代表种的Whirly蛋白进行序列比对,而后构建系统进化树.[结果]从青花菜中克隆到Whir-ly基因家族的3个成员,命名为BoWHY1、BoWHY2和BoWHY3,其基因长度分别为795、723和783 bp,推导分别编码264、240和260个氨基酸.系统进化分析表明,低等植物(藻类、苔藓和裸子植物)Whirly 成员位于进化树的底端,被子植物Whirly成员则聚为1个大组.被子植物中乌油樟、葡萄、杨树和木瓜相对独立,挑选的十字花科物种则聚在一起.青花菜BoWHY2与BoWHY1/BoWHY3的亲缘关系相对较远.qRT-PCR分析显示,在渍水胁迫下BoWHY1的表达量随胁迫时间的延长逐渐递减.BoWHY2和BoWHY3的表达量呈现出先上升(2 d)后下降(6 d)的趋势,且BoWHY2的响应更加剧烈.[结论]植物Whirly基因家族可能由一个祖先基因进化而来.在长期进化过程中青花菜旁系同源基因BoWHY1和BoWHY3可能发生了亚功能化,渍水胁迫的表达特征也印证了此观点.

关键词：青花菜、Whirly、系统进化、渍水胁迫、表达特征

所属期刊栏目：35

分类号：S635(蔬菜园艺)

资助基金：浙江省自然基金项目;云南省应用基础研究计划项目;云南省科技厅基础研究专项青年项目;浙江省农业蔬菜新品种选育新品种选育重大科技专项子项目;温州市农业新品种选育协作组子项目

在线出版日期：2023-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2719-2723