昆明犬IGF1R基因克隆及组织表达分析

摘要：

[目的]旨在阐明昆明犬IGF1R基因序列特征及组织表达模式,为深入探究IGF1R基因在昆明犬生长发育中的调控机制及分子遗传育种相关研究奠定基础.[方法]基于分子克隆技术获得昆明犬IGF1R基因编码区序列,利用生物信息学手段进行序列同源性比对、系统进化树分析,对相应的氨基酸序列进行蛋白理化特性、蛋白结构特征分析,并构建蛋白质三级结构模型.同时利用qRT-PCR方法检测该基因在昆明犬各组织的表达情况.[结果]昆明犬IGF1R基因CDS区长4104 bp,编码1367个氨基酸,其核苷酸序列与家犬(100％)与赤狐(99.3％)的同源性较高,与鸡的同源性较低(78.8％)oIGF1R蛋白分子质量和理论等电点分别为154 890.07 ku和5.58,包含3个纤连蛋白型结构域,1个半胱氨酸富集区和1个酪氨酸激酶结构域,属亲水性跨膜蛋白;亚细胞定位分析表明,IGF1R蛋白均匀地分布于内质网、高尔基体及质膜上,比例均为33.3％;磷酸化位点分析发现,IGF1R蛋白存在123个磷酸化位点;该蛋白的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.组织表达显示,IGF1R基因在昆明犬不同组织中均有表达,尤其在肺脏、心脏及肾脏中呈现高表达.[结论]IGF1R基因在生物进化过程中具有较强的保守性.昆明犬IGF1R蛋白具有IGF受体蛋白特征性结构域,属亲水性跨膜蛋白.IGF1R基因在昆明犬6个组织中均有表达,其中心脏、肺脏及肾脏组织中的表达量较高.

关键词：昆明犬、IGF1R基因、克隆、序列分析、组织表达

所属期刊栏目：35

分类号：S829(家畜)

资助基金：云南省科技厅基础研究计划项目;公安部科技强警基础工作专项项目

在线出版日期：2022-12-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2197-2203