辣椒不同发育时期果实的转录组分析

摘要：

[目的]广泛深入认识辣椒素生物合成的调控因素,为辣椒生物技术育种工作提供分子基础.[方法]对2个不同辣度的辣椒材料'754-3-1-1-1'和'渝椒5号'快速生长期(KS)和绿熟期(LS)的果实分别进行转录组测序,通过Cufflinks软件进行基因差异表达分析并利用荧光定量RT-PCR验证基因表达数据的准确性,比较2个材料2个发育时期的转录组数据获得差异表达基因,并对差异表达基因进行 GO功能富集分析.[结果]L754LS_vs_L754KS、YJ5LS_vs_YJ5KS、L754KS_vs_YJ5KS 和 L754LS_vs_YJ5LS 4组对比分别有139、1903、5550和3220个差异表达基因.2个材料在KS期有2667个(48％)特有的差异表达基因,在LS期有871个(27％)特有的差异表达基因.4组对比数据的差异表达基因中共鉴定到18个CapCyc模型基因,其中PAL、CCoAOMT和CCR 等辣椒素合成途径中的结构基因在不同样品中表达差异3倍以上.此外,还鉴定出可能参与调控辣椒素合成的36个MYB家族转录因子和4个ERF转录因子.[结论]辣椒素含量受果实发育早期基因的表达水平影响更大.PAL等结构基因可能具有调控辣椒素物质生物合成的作用.本研究为辣椒素生物合成的调控网络研究提供了更多的候选基因.

关键词：辣椒、辣椒素类物质生物合成、调控、果实、转录因子、MYB、ERF

所属期刊栏目：35

分类号：S641.3

资助基金：重庆市自然科学基金面上项目cstc2019jcyj-msxmX0039

在线出版日期：2022-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：517-525