枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类(CAZymes)的分布与进化分析

摘要：

[目的]分析枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类的分布与进化情况,对枯草芽孢杆菌工业菌株的开发利用具有重要意义.[方法]利用CAT在线预测程序对前期获得的102个分泌蛋白序列进行CAZymes预测.[结果]明确枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的数量为57个,分别为27个GH、21个CBM、2个CE、4个PL、1个GT和2个GH/CBM.同时,通过对上述CAZymes进行遗传关系分析,明确存在GH/PL/CBM、GH/CBM、GH/CBM/CE/PL、GH/CBM/CE/PL/GT等大的类别;以及通过对上述蛋白互作关系分析,发现大部分CAZymes蛋白已具有明显的结构特征和相互作用的关系.[结论]完成了枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的预测,并明确CAZymes在分类方面尚需进一步细分为亚类,该项目为开展工业菌株发挥CAZymes蛋白功能研究打下了坚实的理论基础.

关键词：枯草芽孢杆菌BEST195;碳水化合物活性酶;预测程序;遗传关系

所属期刊栏目：34

分类号：S436(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目;云南省应用基础研究计划项目;西南林业大学大学生创新创业项目

在线出版日期：2021-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1195-1200