燕麦SCoT分子标记体系的优化及引物筛选

摘要：

[目的]本研究对影响燕麦目标起始密码子多态性聚合酶链式反应(SCoT-PCR)的4个因素(模板DNA、引物、Mix混合液用量及退火温度)进行了优化,并通过最优体系进行了多态性引物的筛选.[方法]以4份燕麦品种DNA为模板,采用L9 (33)正交试验确定模板DNA、引物、Mix混合液用量的最优反应体系,在48～ 54℃温度范围设置8个梯度进行退火温度筛选,并通过最优体系对80条引物进行了多态性筛选和验证.[结果]优化后的反应体系总体积为20μl,包含2 μl模板DNA(10 ng·μl-1)、2μl引物(10 μmol· L-1)、9μl Mix和7μl ddH2O.筛选出了扩增效果和多态性较好的36条引物及各自的最佳退火温度.[结论]成功优化建立燕麦SCoT-PCR扩增体系,该体系的建立将为燕麦品种遗传多样性分析、品种指纹图谱构建以及分子标记辅助育种等提供重要的参考依据.

关键词：燕麦、SCoT、体系优化、引物筛选

所属期刊栏目：34

分类号：S512.6(禾谷类作物)

资助基金：国家重点研发计划;四川省应用基础研究计划;中央高校基本科研业务费专项西南民族大学项目

在线出版日期：2021-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：940-944