板栗PPO基因克隆及生物信息学分析

摘要：

[目的]研究PPO基因在栗仁受热褐变物质代谢中的生理功能.[方法]在对板栗果实转录组测序的基础上,获得1条PPO unigenes,克隆并对其进行生物信息学分析.[结果]克隆PPO基因完整开放阅读框1794 bp,命名为CmPPO,编码597个氨基酸,属于络氨酸酶基因家族蛋白,包含络氨酸普通中心区域和多酚氧化酶中间保守域.CmPPO编码的多酚氧化酶属于亲水性蛋白质,相对分子量66 335.38,理论等电点(pI)6.45,属于酸性蛋白,不存在跨膜区,不属于膜结合蛋白.CmPPO蛋白酶的二级结构α-螺旋比例21.22％,无规则卷曲59.13％,延伸主链15.91％,β-转角3.85％.三级空间结构模型分析与蔷薇科苹果络氨酸酶结构(MdPPO1)有72.75％的序列一致度,53％的序列相似度,氨基酸序列一致性达到68.43％,推测它们具有类似功能.通过qRT-PCR验证,CmPPO基因在板栗不同品种、果实不同组织中表达差异与果实褐变度不一致,在弱褐变品种中表达却最高.[结论]褐变不是单基因控制,而是多基因、多种代谢途径共同参与作用的结果.

关键词：板栗、果实、PPO基因、生物信息学、表达分析

所属期刊栏目：33

分类号：S664.2(果树园艺)

资助基金：科技部重点专项;北京市农林科学院青年科研基金

在线出版日期：2020-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1360-1365