罗氏沼虾TRY基因生物信息学及其mRNA表达分析

摘要：

[目的]分析罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)胰蛋白酶(TRY)基因的生物信息学及其mRNA的表达情况,为深入探究TRY基因的生物学功能和提高罗氏沼虾产量提供参考依据.[方法]利用MegAlign、ProtParam、ProtScale和MLRC等在线软件对罗氏沼虾TRY基因进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR检测其在罗氏沼虾腹部神经、胃、心脏、鳃、性腺、肝胰腺、肌肉和肠道等8个组织中的表达情况,进一步分析TRY基因在罗氏沼虾生长快速家系(FG)和生长慢速家系(SG)个体肌肉组织中的表达规律.[结果]罗氏沼虾TRY氨基酸序列与刀额新对虾(Metapenaeus ensis)TRY氨基酸序列的同源性最高,与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei) TRY氨基酸序列的同源性最低.罗氏沼虾TRY蛋白的分子量为28.54 kD,理论等电点为4.44,属于疏水性蛋白.罗氏沼虾TRY蛋白二级结构中α-螺旋占17.67％,延伸链占21.05％,无规则卷曲占61.28％.罗氏沼虾TRY基因在所检组织中均有表达,在雌性和雄性个体的肝胰腺组织中均高表达,而在雌性个体的鳃和雄性个体的肌肉组织中低表达.此外,罗氏沼虾TRY基因在FG个体肌肉组织中的表达量极显著高于在SG个体肌肉组织中的表达量(P＜0.01).[结论]罗氏沼虾与刀额新对虾的亲缘关系最近;TRY基因在罗氏沼虾各组织中均广泛表达,以在雌、雄罗氏沼虾肝胰腺组织中表达量最高,且存在性别差异性.TRY基因在罗氏沼虾生长发育过程中发挥了重要作用,可能正向调控罗氏沼虾的生长发育.

关键词：罗氏沼虾、生长性状、TRY基因、基因表达、生物信息学

所属期刊栏目：33

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：广西科技重大专项;广西自然科学基金项目;广西博士后“两站”项目

在线出版日期：2020-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1327-1331