基于高通量转录组测序的白芷差异表达基因分析

摘要：

[目的]为获得白芷转录组序列信息,了解不同产地间白芷的差异表达基因情况.[方法]以白芷根为研究对象,采用Illumina HiSeqX Ten平台对不同产地白芷进行高通量转录组测序,并对其差异表达基因进行筛选和分析.[结果]川白芷产地间、亳白芷产地间及川白芷与亳白芷间的差异基因总数分别为2686、1704、11 549条,分别被GO富集注释11 038、434、5604条,差异基因的主要功能与细胞组成、细胞、细胞器、结合、催化活性、细胞过程及代谢过程有关.KEGG通路分类显示,差异表达基因被分为4大类,24个小类,所在通路主要与代谢过程相关.与白芷主要化学成分香豆素和挥发油合成相关的4-香豆酸连接酶、丙氨酸氨解酶、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶在川白芷中表达量升高,1-脱氧-D-木糖-5-磷酸合成酶、脱氢多萜醇焦磷酸合成酶在川白芷中表达量降低.[结论]通过转录组测序分析了不同产地白芷根基因差异表达状况,为白芷药材道地性品质的形成提供了理论依据.

关键词：白芷、转录组测序、差异表达基因

所属期刊栏目：33

分类号：S567.239(经济作物)

资助基金：四川省基本科研业务专项;中央本级重大增减支项目;四川省科技厅重点研发项目;“重大新药创制”科技重大专项项目

在线出版日期：2020-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：233-240