光周期影响罗非鱼脑组织转录组基因表达分析

摘要：

[目的]发掘尼罗罗非鱼响应光周期变化的重要功能基因,为研究光周期变化对罗非鱼产生影响的分子机制提供参考.[方法]采用新一代高通量测序RNA-seq技术分析24L:0D、12L:12D和0L:24D 3个光周期条件下尼罗罗非鱼脑组织基因表达变化情况.[结果]转录组测序结果显示:3个组别分别产生55 524 504、61 410 946和58 855 762个Clean reads.12L:12D光周期与0L:24D光周期文库比较发现279个差异表达基因,12L:12D光周期与24L:0D光周期文库比较发现304个差异表达基因,24L:0D光周期与0L:24D光周期文库比较发现383个差异表达基因.GO分类分析表明,差异表达基因属于生物学过程、细胞定位和分子功能的42个类别.KEGG通路显著性富集分析差异表达基因共涉及143条代谢途径,包括单纯疱疹感染、ECM-受体相互作用、细胞因子-细胞因子与受体相互作用、肠道IgA生成免疫网络、细胞粘附分子(CAMs)、Wnt信号等通路.[结论]光周期变化影响尼罗罗非鱼脑组织基因表达水平,表达差异基因主要富集在单纯疱疹感染、细胞因子-细胞因子与受体相互作用、Wnt信号通路等信号通路.

关键词：尼罗罗非鱼、脑组织、光周期、高通量测序、转录组

所属期刊栏目：32

分类号：S965.125(水产养殖技术)

资助基金：广西创新驱动发展专项资金项目桂科 AA17204094-2

在线出版日期：2020-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2704-2711