荔枝DA1同源基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

[目的]克隆荔枝种子大小调控基因DA1,对其进行生物信息学分析.为深入研究荔枝LcDA1基因的功能提供理论参考.[方法]利用生物信息学软件对荔枝DA1同源基因及其编码蛋白进行预测和分析.以荔枝种子cDNA为材料,采用RT-PCR扩增3个LcDA1基因全长.[结果]根据转录组数据获得3个DA1同源基因,分别命名为LcDA1-1、LcDA 1-2和LcDA1-3.开放阅读框(ORF)分别为1479,1419和1104 bp,分别编码492,472和367个氨基酸.氨基酸序列分析结果显示3个蛋白均含有典型的UIM和LIM结构域.[结论]荔枝LcDA1蛋白具有典型的DA1保守结构域,可能在荔枝种子发育中具有重要作用.

关键词：荔枝、DA1基因、结构域、开放阅读框

所属期刊栏目：32

分类号：S667.1(果树园艺)

资助基金：广东省自然科学基金2018A030307007;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项1630062019020;国家现代农业荔枝龙眼产业技术体系CARS-032

在线出版日期：2020-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2509-2513