植物三萜皂苷代谢中细胞色素P450的生物信息学分析

摘要：

[目的]细胞色素P450 (CYP450)是植物三萜皂苷代谢通路中的关键酶,本文从生物信息学角度对其蛋白特性及亲缘关系进行分析.[方法]从已发表的文献及NCBI中搜集植物细胞色素P450序列,分别使用ProtParam、ORFfinder、SignalP4.1、SOPMA、CDD和MEGA6.O工具对其理化性质、开放阅读框、信号肽、二级结构、保守结构域和亲缘关系进行分析.[结果]获得21种植物的23条细胞色素P450序列;这23条序列在基因序列长度、氨基酸数目,pI及氨基酸组成,均表现出较强的一致性;只有美洲商陆、甜菜和甜椒这3条序列有信号肽;二级结构具有明显的一致性,并且α-螺旋和无规则卷曲是主要的结构元件;大多数植物细胞色素P450的保守结构域同属于P450超家族;进化树表明细胞色素P450差异较小.[结论]这21种植物的细胞色素P450蛋白特性差别不大,进化距离也比较近,显示细胞色素P450具有较高的保守性和稳定性.本文将为细胞色素P450酶学特征分析及植物中三萜皂苷代谢研究提供帮助.

关键词：细胞色素P450、生物信息学分析、蛋白特性、系统进化

所属期刊栏目：32

分类号：Q946.5(植物学)

资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目201811396018X

在线出版日期：2019-12-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2304-2312