10.16213/j.cnki.scjas.2019.9.010
雨生红球藻UVR8的基因克隆和生物信息学分析
[目的]获得雨生红球藻中紫外抗性蛋白(Uv resistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全长,并进行生物信息分析.[方法]以雨生红球藻为研究对象,通过同源克隆方法获得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全长,并通过生物信息手段对其理化性质、蛋白结构及系统进化进行分析.[结果]序列分析表明,HaeUVR8的编码区全长为1554bp,共编码517个氨基酸,预测理论等电点为5.56,理论分子量为54.31 kD.通过BLASTp分析,与拟南芥中UVR8的相似性达到51%,与莱茵衣藻中UVR8的相似性达到59%.通过蛋白保守结构域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型结构域,包括7个叶片螺旋结构和保守的色氨酸残基.系统进化分析表明,高等植物和真核绿藻来源UVR8s有共同祖先.[结论]本研究首次获得雨生红球藻中编码UVR8的基因序列,发现其结构与高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用机制,为雨生红球藻中UVR8的表达、功能研究奠定基础,同时为解析雨生红球藻适应紫外光的分子机制提供线索.
紫外抗性蛋白、cDNA全长、结构域、系统进化、雨生红球藻
32
S123(农业物理学)
国家海洋局海洋生物活性物质与现代分析技术重点实验室开放基金MBSMAT-2016-03;博士后面上资助基金2018M631768;国家“948”项目2014-Z39;山西省煤基重点科技攻关项目FT-2014-01;山西省重点科技项目201603D312005
2019-11-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
2025-2032