25个鸡品种DMB2基因序列比较分析

摘要：

[目的]DMB2(major histocompatibility complex,class Ⅱ,DM beta2)基因是鸡MHCⅡ类的典型基因座,通过比较不同鸡品种的DMB2基因序列探究该基因对鸡的免疫反应和抗病性的作用和意义.[方法]本研究对25个不同鸡种的DMB2基因序列进行目标捕获测序,以NCBI上Gallus gallus的DMB2基因序列作为参考序列,通过MEGA6软件进行序列比对分析,筛选出不同鸡种DMB2基因序列上的SNPs和Indels位点以及氨基酸的变化,并根据基因序列的差异构建系统进化树,探究不同鸡种的同源性.[结果]结果表明DMB2基因表现其遗传多态性的同时呈现出较高的保守性,外显子上突变和插入缺失较少.进化树分析显示抗病性较强的鸡种广西黄鸡、SPF-来航鸡、藏鸡、雪山草鸡的同源性较高.[结论]不同鸡种中DMB2基因呈现出较高的保守性,在进化过程中不易发生突变,该基因在鸡的免疫反应中具有重要作用.

关键词：鸡、DMB2基因、SNPs、Indels、进化树

所属期刊栏目：32

分类号：S813.2(普通畜牧学)

资助基金：国家科技支撑计划“鸡种质资源培育与创新利用”2015BAD03B03;江苏省六大人才高峰项目资助“禽类PIWI蛋白在配子形成中表遗传调控机制研究”2015-NY-019

在线出版日期：2019-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1961-1965