类乌齐牦牛ACTA1基因克隆、分子特性及差异表达分析

摘要：

[目的]骨骼肌α肌动蛋白1(actin alpha1,ACTA1)主要参与骨骼肌纤维的发育,在骨骼肌活动中发挥重要作用.本试验主要扩增类乌齐牦牛ACTA1基因的cDNA序列,检测ACTA1基因在类乌齐牦牛不同组织中mRNA水平的表达规律.[方法]采用RT-PCR方法扩增并克隆类乌齐牦牛ACTA1基因CDS区;通过在线软件对其一级结构、二级结构、三级结构进行生物信息学分析;利用核苷酸序列及氨基酸序列进行同源性和系统进化树分析;应用RT-qPCR技术检测ACTA1基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达模式.[结果]类乌齐牦牛ACTA1基因编码区全长1134 bp,结构稳定,共编码377个氨基酸.生物信息学分析发现,类乌齐牦牛ACTA1基因编码的蛋白质是一种结构较稳定、带负电的亲水性蛋白,二、三级结构以α-螺旋为主,包含2个明显的跨膜区域,无信号肽,属胞内蛋白.保守结构域中含有明显的NDB区域,蛋白结构高度保守.同源性分析表明,类乌齐牦牛与水牛ACTA1基因的核苷酸及氨基酸同源性均较高.系统进化树分析显示,类乌齐牦牛与水牛亲缘关系最近,黄牛次之.实时荧光定量PCR结果显示,ACTA1基因在臀肌和大脑高表达.[结论]获得类乌齐牦牛ACTA1基因的CDS区全长1134 bp,ACTA1基因在类乌齐牦牛肌肉和大脑组织中显著表达,为进一步研究分析ACTA1基因在调控牦牛肌肉发育及机制等方面奠定基础.

关键词：类乌齐牦牛、ACTA1基因、克隆、生物信息学分析、组织表达

所属期刊栏目：32

分类号：S823.8+5(家畜)

资助基金：西南民族大学研究生创新型科研项目CX2018SZ114;国家肉牛牦牛产业技术体系CARS-37

在线出版日期：2019-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1435-1442