基于银耳转录组测序的多糖代谢途径分析

摘要：

[目的]对银耳进行转录组测序分析,分析多糖生物合成途径和挖掘关键功能基因.[方法]采用Illumira Hiseq 2500测序平台对银耳菌丝体进行测序,组装得到unigene序列,并与公共数据库进行对比分析和注释,挖掘果糖和甘露糖代谢通路相关基因.[结果]本研究共得到4.72 Gb raw data,拼接后获得17 008条unigene序列,N50为2073 bp;注释结果表明,76.47％序列能够注释到Uniprot公共数据库,注释到GO分类和KEGG通路的unigene分别为10 152和5671条.进一步分析银耳果糖和甘露糖代谢途径相关基因,挖掘得到74条u nigene;其中编码L-iditol 2-dehydrogenase的unigene最多,其次是butanol dehydrogenase.[结论]基于转录组测序数据解析及预测,为研究银耳多糖和其它产物的生物合成途径及分子机制提供了数据支持,也为银耳品质的形成提供理论依据.

关键词：银耳、转录组、果糖和甘露糖代谢途径

所属期刊栏目：32

分类号：S646.6

资助基金：四川省财政创新能力提升工程专项资金项目2013GXJS-014

在线出版日期：2019-08-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1347-1352