基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析

摘要：

[目的]利用生物信息学分析方法推导CsbHLH62基因及其编码产物的理化性质、结构和功能以及同源性等.[方法]通过相关软件及网站分析CsbHLH62基因及其编码蛋白的相关信息.[结果]CsbHLH62基因编码蛋白含有277个氨基酸,是一种可溶性蛋白,定位于细胞核,该蛋白不存在信号肽,无跨膜结构,有35个潜在的磷酸化位点,是一种非分泌蛋白;功能结构分析表明131～181位氨基酸之间有一个典型的MYC的bHLH结构域,系统进化分析表明其编码的氨基酸序列与欧洲越橘亲缘关系较近,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,三维结构构建成功.[结论]为研究CsbHLH62基因在茶树硒富集过程中的生物学功能奠定了基础.

关键词：茶树、转录组测序、转录因子、生物信息学

所属期刊栏目：32

分类号：S571.1

资助基金：湖北省农业科技创新中心项目2016-520-000-001-032;湖北省农业科学院青年基金项目2018NKYJJ12;信阳农林学院河南省豫南茶树资源综合开发重点实验室开放基金HNKLTOF2017002

在线出版日期：2019-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：36-41