10.16213/j.cnki.scjas.2018.12.009
95份甘蔗栽培材料的SSR引物筛选及遗传多样性分析
[目的]筛选适用于甘蔗主产区种质资源的SSR核心引物,探究中国主要甘蔗材料的遗传多样性和群体结构,为甘蔗亲本材料的保存、利用、甘蔗分子标记辅助选择提供参考.[方法]利用从68对SSR引物中筛选获得的21对核心引物,对采集到的19个群体共95份甘蔗育种亲本材料进行遗传多样性分析.利用Powermarker V3.25数据处理软件计算引物的多态性信息量(PIC).根据SSR分子标记数据,计算19个群体的Nei72遗传距离矩阵.利用Powermarker V3.25软件,对供试材料基于SSR标记的遗传距离矩阵进行相关性分析.根据遗传距离矩阵,利用Mega6.06软件分别对19个群体进行基于分子标记的类平均法(unweightedpair group method with arithmetic mean,UPGMA)聚类分析.根据SSR分子标记数据,利用STRUCTURE 2.4对19个群体的95份供试材料进行群体结构分析.[结果]从已公布的68对SSR引物中,筛选获得21对多态性高、稳定性好、综合表现良好的甘蔗SSR分析引物,21对引物中PIC值最大的是0.9279,最小值为0.7855,平均值为0.8664.21对SSR引物共检测出440个甘蔗DNA条带,其中多态性条带数为422个,扩增的DNA条带范围集中在100～ 500 bp之间.19个群体的Nei72遗传距离最小的为0.2024,最大的为0.7262,平均遗传距离为0.5779,根据UPGMA聚类图可将19个群体划分为4个亚群.群体结构分析表明,当K值等于6时,△K取得最大值,说明19个群体的95份材料可以划分为6个亚群,亚群Ⅰ含有4个群体分别为TZ01、GZ01、TZ02、TZ10,亚群Ⅱ含有2个群体为TZ07、TZ08,亚群Ⅲ为TZ11、GZ06、GZ08,亚群Ⅳ分别为GZ07、GZ03、GZ04、GZ05,亚群V分别为TZ04、TZ06、TZ05、TZ03、TZ09,亚群Ⅵ只含有一个群体为GZ02.[结论]21对SSR引物能够很好的区分本研究的各个材料,同时供试材料基因组水平的遗传多样性较丰富,可为上述亲本资源的利用奠定良好的基础,并为今后研究中的亲本选择和组合等方面提供重要参考.
甘蔗、SSR引物、遗传多样性、群体结构
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S566.1(经济作物)
中国农业科学院科技创新工程“南方经济作物栽培与收获技术”CAAS-ASTIP-2017-IBFC06;中央级公益性科研院所基本科研业务费“苗期甘蔗低温胁迫下的生理响应及差异基因表达分析”1610242016005
2019-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
2498-2505
