谷子eIF5A基因家族鉴定与分析

摘要：

[目的]本文系统分析了谷子eIF5A基因家族在谷子中如何发挥作用.[方法]利用谷子基因组数据库,运用生物信息学方法,鉴定谷子eIF5A基因家族的基因结构、染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化和分类分析.[结果]谷子含有4个eIF5A基因,均含有4个内显子,分布于谷子的3条染色体上.MEME保守基序分析显示,谷子eIF5A蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287).磷酸化位点预测分析表明谷子eIF5A蛋白均含有大量潜在磷酸化位点.[结论]以上结果将为今后揭示谷子eIF5A蛋白功能提供重要的线索.

关键词：谷子、eIF5A、基因家族、进化分析

所属期刊栏目：31

分类号：S515(禾谷类作物)

资助基金：北京市科技计划Z161100000916003;北京市农林科学院科技创新能力建设专项KJCX20140202;北京市农林科学院青年科研基金QNJJ201504

在线出版日期：2018-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1333-1337