10.16213/j.cnki.scjas.2018.6.002
白及GMP基因cDNA全长克隆及生物信息学分析
[目的]克隆白及GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-mannose pyrophosphorylase)基因(BsGMP)cDNA全长序列,分析该基因生物学信息,为该基因功能的进一步鉴定提供依据.[方法]基于同源序列克隆GMP基因中间片段,并采用RACE技术扩增GMP基因cDNA全长,用DNAMAN、Tmpred及Softberry等软件进行编码多肽序列、理化性质及亚细胞定位等分析.[结果]从白及叶片中克隆到的GMP基因全长1523 bp,其中包含1086 bp的开放阅读框(ORF),编码361个氨基酸,理论蛋白分子量为39.35 kDa,理论等电点为6.03.进一步分析发现该基因具有跨膜结构,亚细胞定位分析发现该基因主要分布于细胞质和线粒体.蛋白三级结构预测显示,BsGMP蛋白有11个α螺旋,33个B折叠,46个B转角;该蛋白第1～24个氨基酸含有醛酮还原酶的保守结构域,第256～335个氨基酸含有LbetaH家族保守区.BLAST多重序列分析表明,BsGMP氨基酸序列与铁皮石斛、蝴蝶兰的亲缘性最高,分别达到95％和92％.[结论]成功克隆到白及GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(BsGMP),并进行相关生物信息学分析,为该基因的进一步功能研究奠定了基础.
白及、GMP、基因克隆、序列分析
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S567.2(经济作物)
广西自然科学基金-青年基金项目2016GXNSFBA380124;广西农业科学院成果转化项目2017NZ09;广西农业科学院优势学科团队项目2018YT20
2018-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
1104-1110
