全基因组预测里氏木霉QM6a的碳水化合物活性酶类蛋白

摘要：

[目的]里氏木霉QM6a是一株产纤维素酶的重要工业菌株,明确该菌中碳水化合物活性酶类蛋白(CAZymes),为进一步开展其功能研究打下坚实的理论基础.[方法]基于前期所获得的356个分泌蛋白数据,利用CAT预测程序对其CAZymes进行分析.[结果]里氏木霉QM6a中含有201个CAZymes,可以分为主要类别、复合类别,主要类涉及93个GHs和52个CBMs以及15个AAs、14个CEs、5个PLs、4个GTs;复合类别则涉及15个GH/CBMs和1个AA/CBMs以及2个CE/CBMs.[结论]通过上述生物信息学分析方法有效地实现了里氏木霉碳水化合物活性酶蛋白的预测.

关键词：里氏木霉、碳水化合物酶类、预测程序、生物信息学

所属期刊栏目：31

分类号：S436(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目“钩状木霉与枯草芽孢杆菌对核桃炭疽病的协同生防作用机制研究”31560211;云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目“钩状木霉与枯草芽孢杆菌对核桃炭疽病的协同控制技术研究”ZK150004;云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目50097505;云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队2014015

在线出版日期：2018-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：705-710