水淹胁迫下三峡库区消落带适生狗牙根转录因子的转录组分析

摘要：

[目的]从转录水平整体分析狗牙根在水淹生境下的基因表达模式对探索植物的抗水淹机制具有重要意义.[方法]本研究通过转录组测序研究了水淹(处理组)和非水淹(对照组)生境下的三峡库区消落带适生狗牙根的转录因子(transcription factor,TF)基因表达变化.[结果]测序数据经拼接共获得147 256条非冗余Unigenes,经Nr、Nt、Swissprot、KEGG、COG、Interpro和GO数据库可注释72.84％的Unigene;筛选到与狗牙根响应水淹胁迫有关的54个家族的785条差别表达TF,其中属于27个家族的348条TF上调表达,34个家族的437条TF下调表达;WRKY、bHLH、MYB、AP2-EREBP、MYB-rei()d、Trihelix、NAC、MADS和TCP等是9个差异表达TF数量最多和表达量变化最显著的TF家族.基于实时定量PCR对水淹生境下狗牙根TF表达水平进行了检测,结果与转录组分析基本一致.[结论]初步分析了水淹生境下狗牙根转录因子的特征表达谱,为进一步筛选与抗水淹有关的关键基因和调控基因提供基础.

关键词：狗牙根、水淹胁迫、转录组分析、TF、差异表达基因

所属期刊栏目：31

分类号：Q945.79(植物学)

资助基金：重庆市教委科学技术研究项目KJ1401001;重庆市教委科学技术研究项目KJ1501011;重庆市自然科学基金cstc2016jcyjA2135;重庆市自然科学基金cstc2016jcyjA2132;渝东北特色生物资源开发利用工程中心资助

在线出版日期：2018-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：265-269