10.16213/j.cnki.scjas.2018.2.005
基于甾体皂苷的襄麦冬块根抑制性差减杂交文库的构建
[目的]甾体皂苷是襄麦冬块根主要活性成分之一,为了能在分子水平上实现对相关基因的表达调控,从而使甾体皂苷含量的提高成为可能,筛选参与甾体皂苷合成的蛋白或酶就非常必要.[方法]本实验以襄麦冬始见期块根和采收期块根作为实验样品,构建了不同生育期襄麦冬块根抑制性差减杂交(SSH)文库.[结果]构建的始见期和采收期块根差减文库的外源片段,有效基因序列308条,长度主要分布在250～1000 bp左右,片段平均长度586.99 bp;文库样本序列注释上NR、SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM库的基因分别有65.26％、34.42％、63.96％、26.30％、14.94％;样本中分别有23和103个Unigene可注释上12个COG分类与19个KOG分类中;样本中有81个预测基因,可以注释到48种酶与映射到92个代谢通路上;样本基因功能在Biological Process分类中聚集于cellular process和metabiolie process,在Cellular Component主要聚集于cell、cell part和intracellular,在Molecular Function分类中主要聚集于catalytic activity,binding和transferase activity.[结论]本实验成功构建了基于甾体皂苷的襄麦冬块根抑制性差减杂交文库,筛选出一批差异表达目的基因.
襄麦冬、SMART法、甾体皂苷、抑制性差减杂交、EST序列分析
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S567(经济作物)
国家星火计划面上项目2015GA760011;湖北省自然科学基金面上项目2013CFC025;湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队计划项目T201616
2018-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
245-252
