滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的分子鉴别研究

摘要：

[目的]为了解滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的种类组成.[方法]采用引物NirS1F/NirS6R和Me1/Me2分别对沉积物总DNA进行PCR扩增,得到1000 bp的反硝化细菌和760 bp的产甲烷菌特异性片段.[结果]证实了滇池沉积物中存在反硝化细菌和产甲烷菌,且推测产甲烷菌的丰度高于反硝化细菌.2个克隆文库分别获得阳性克隆子55和99个,利用Mothur软件将序列分别划分为10和5个OUT,说明尽管反硝化细菌的丰度低于产甲烷菌,但物种多样性高于产甲烷菌.运用BLASTN程序在GenBank数据库中进行序列比对,发现55个反硝化细菌阳性克隆子可分为10个种类,OTU10类序列与细菌Dechloromonas aromatica的相似性达86％,是反硝化细菌中的优势类群;99个产甲烷菌阳性克隆子可分为5个种类,OTU5类序列与甲酸甲烷规则菌(Methanoregula formicicum)相似性达86％,该类群是反硝化细菌中的优势类群.[结论]滇池沉积物中的反硝化细菌与产甲烷菌多为潜在的未被培养的新种.

关键词：滇池、沉积物、反硝化细菌、产甲烷菌、分子鉴别

所属期刊栏目：31

分类号：Q948(植物学)

资助基金：昆明学院科学研究项目XJZD1606;云南省应用基础研究青年项目2013FD040;昆明学院“人才引进项目”YJL14005;云南省高校优势特色重点学科生态学建设项目05000511311;云南省特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金项目GXKJ201631

在线出版日期：2018-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：154-159