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10.16213/j.cnki.scjas.2018.1.005

茶组植物种间关系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析

引用
[目的]DNA序列分析在物种系统进化、分类和鉴定等方面展示出了强大的生命力.[方法]本研究对来源于cpDNA、rD-NA ITS和mtDNA序列的15对引物在茶组植物的5种2变种共16份资源中进行了种间关系研究.[结果]在15对引物中,来自cpDNA的6对引物有5对完成了扩增与测序,来自rDNA ITS的3对引物均未得到单一目的片度,来自mtDNA序列的6对引物中,共有4对完成了扩增与测序.对在种间存在位点差异的8对引物序列比对:序列长度最长的为390F-1326R(859 bp),最短的为orf25(446 bp);品种间变异位点最多的为rbcla-rev(24个),最少的为nad4I/orf25(2个).位点变异率最高的为rbcla-rev(4.76%),最低为nad4L/orf25(0.37%),cpDNA的碱基变异率平均值(2.91%)要远高于mtDNA (0.55%);8对引物在茶变种内发生变异的位点共有9个,占总位点数的0.19%;不同变种间发生变异的位点有90个,占总位点数的1.85%;将8对引物测序得到的序列拼接,按照MP法构建了分子系统树,可以将参试的16份茶树资源分为3大类.[结论]本研究为DNA序列分析在茶组植物中的应用提供了参考.

茶树、种间关系、cpDNA、mtDNA、序列分析

31

S571.1

国家自然科学基金项目31500565;现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-23

2018-03-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

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西南农业学报

1001-4829

51-1213/S

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2018,31(1)

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