10.16213/j.cnki.scjas.2017.11.007
甜高粱WRKY转录因子基因的克隆与表达分析
[目的]克隆甜高粱WRKY基因,分析其序列特征和表达谱,为甜高粱抗旱育种提供基因来源.[方法]以甜高粱品种M81-E幼苗总RNA为模板,利用RT-PCR技术克隆甜高粱WRKY基因,通过生物信息学软件分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR检测基因表达情况,获得2条WRKY基因,命名为SbWRKY1(Genebank登录号:KY231904)和SbWRKY2(Genebank登录号:KY231905).[结果]SbWRKY1 cDNA序列全长1086 bp,包括1个1059 bp的开放阅读框,编码352个氨基酸.SbWRKY2 cDNA序列全长750 bp,包括1个717 bp的开放阅读框,编码238个氨基酸.2个基因编码的蛋白均具有WRKY核心序列“WRKYGQK”和“C-X4-5-C-X22-23-H-X1-H”锌指结构模型.SbWRKY1蛋白分子式为C1628H2619N509O504S16,预测蛋白质分子量为37.89 kDa,等电点(PI)为9.78.SbWRKY2蛋白分子式为C1131H1752N326O344S21,预测蛋白质分子量为26.09 kDa,等电点(PI)为8.43.系统进化树分析表明,SbWRKY1蛋白与高粱、玉米和谷子WRKY蛋白亲缘关系较近,SbWRKY2蛋白与高粱、芒草和玉米WRKY蛋白亲缘关系较近.荧光定量PCR分析表明,随着干旱胁迫时间延长,SbWRKY1和SbWRKY2呈上调表达趋势.[结论]SbWRKY1和SbWRY2基因可能在甜高粱应对干旱胁迫中发挥一定作用.
甜高粱、转录因子、WRKY、RT-PCR
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S514.03;Q943(禾谷类作物)
中国热带农业科学院湛江实验站科研启动专项资金项目zjky201504;中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金项目17CXTD-07
2018-01-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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