兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析

摘要：

[目的]为研究兰花(Phalaenopsis equestris)中PI-PLC基因家族各成员在兰花中的生理功能.[方法]利用兰花基因组数据库,经过生物信息学分析,获得兰花PI-PLC基因家族成员的基因结构、染色体定位和编码蛋白,经过多重序列比对进行进化和分类分析.[结果]结果表明:兰花基因组中含有3个PI-PLC家族基因成员,分别含有9～13个外显子.TMHMM跨膜区结构分析显示,兰花PI-PLC蛋白均不合有跨膜区;MEME保守结构域分析显示,兰花PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域.[结论]以上结果对解析兰花PI-PLC蛋白的生物学功能提供重要的线索.

关键词：磷酸肌醇特异性磷脂酶C、兰花、基因家族、进化分析

所属期刊栏目：30

分类号：S682.31(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：北京市科技计划Z171100001517011;北京市农林科学院青年科研基金项目QNJJ201416;北京市农林科学院科技创新能力建设专项KJCX20170203

在线出版日期：2017-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2218-2223