利用野栽分离群体定位水稻粒型相关QTL

摘要：

[目的]挖掘水稻粒型相关QTL位点可为水稻的粒型遗传机制研究和优质化分子育种提供理论基础.[方法]以广西普通野生稻高代自交系材料ZY03为父本,栽培稻品种日本睛为母本,通过常规杂交获得包含160个单株的F2分离群体,并开展粒长、粒宽及粒长宽比等粒型性状的调查.利用分布于水稻12条染色体上的184个SSR标记对F2群体单株进行分子检测.应用MAPMAKER EXP 3.0软件进行数据分析,构建分子标记连锁图.应用QTLmapping3.0软件,采用复合区间作图法(composite inter-valmapping,CIM),以LOD =2.5为阈值检测控制粒长、粒宽和粒长宽比等性状的QTL.[结果]在F2群体中,目标性状呈现连续变异,有明显的双向超亲分离现象.共检测到与粒型相关的QTL 3个,其中1个粒长QTL位于第5染色体RM405～ RM548区间内,被命名为qGL5.1,表型贡献率为10.68％,加性效应为0.02;在第1染色体RM5501～ RM486区间内检测到1个控制粒宽的QTL,被命名为qGW1.1,表型贡献率为10.56％,加性效应为0.34;在第5号染色体RM405 ～ RM548区间检测到1个控制粒长宽比的QTL,被命名为qLWR5.1,表型贡献率为14.77％,加性效应为0.12.上述所有QTL的增效等位基因均来自于亲本ZY03.其中,粒长QTL qGL5.1与粒长宽比QTL qLWR5.1位于同一标记区间内.[结论]从野栽分离群体挖掘到3个野生稻的粒型QTL位点,定位结果可用于下一步主效QTL的精细定位和分子标记辅助选择育种.

关键词：粒长、粒宽、粒长宽比、QTL

所属期刊栏目：30

分类号：S511(禾谷类作物)

资助基金：广西壮族自治区主席科技资金项目“野生稻优异基因的挖掘和利用研究”1517-03;国家科技资源共享服务平台项目“国家野生稻种质资源平台南宁”NICGR2017-039;广西农业科学院基本科研业务专项优势学科团队项目“野生稻资源保护与利用研究”2015YT14;广西农业科学院基本科研业务专项广西药用野生稻基因MKK3的功能验证桂农科2017YZ08;广西野生稻等保护点目标物种居群多样性分析”2015JZ12403;野生稻抗逆基因挖掘[2015JZ24]

在线出版日期：2017-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2161-2167