玫瑰根系AMF 18S rRNA基因克隆文库构建及分析

摘要：

[目的]本文研究了玫瑰根系的AMF多样性和组成结构.[方法]从昆明学院种质资源圃随机采集玫瑰‘卡罗拉’3株,采用CTAB法提取根系DNA,运用巢式PCR扩增AM真菌部分18S rRNA基因区域,扩增产物混合后构建克隆文库,最终确定30个阳性克隆子测序,并对文库进行评价和分析.[结果]文库Coverage C值为80％,但Rarefaction曲线不够饱和,应加大文库克隆子数目;文库多样性参数香农指数和辛普森指数分别为1.432和0.25,物种丰富度为4.0;以98％为界,30条序列被划分为15个OTU,均为Glomus的种类;其中OTU1是文库中的主要类型,OTU2～ OTU9代表了常见类型,而OTU10 ～OTU15为稀有类型;有10个OTU在系统进化树上单独聚类,代表着Glomus较为新颖的种类.[结论]在玫瑰根系发现的15个OTU全为Glomus的种类,其中主要类型1种,常见类型8种,稀有类型6种,具体分类地位均不清楚.

关键词：玫瑰’卡罗拉’、丛枝菌根真菌、克隆文库、系统发育树、评价和分析

所属期刊栏目：30

分类号：S641.2

资助基金：云南省应用基础研究自筹基金项目2013FZ099;云南省高校优势特色重点学科生态学建设项目;昆明学院人才引进基金项目YJL12002;昆明学院校级科学研究一般项目XJL14018;云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金项目GXKJ201623

在线出版日期：2017-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2113-2118