10.16213/j.cnki.scjas.2017.5.005
应用克隆文库构建法研究枇杷根系AMF多样性
[目的]为进一步探寻和利用宝贵的AMF资源提供有效的研究方法.[方法]在昆明学院随机采集枇杷根系作为实验样品,采用CTAB法提取根系DNA,进行18S rDNA PCR扩增,产物连接转入大肠杆菌JM109受体,建立18S rRNA部分基因克隆文库.从文库中随机选取35个白色克隆子,经鉴定,获得30个阳性克隆子,将阳性克隆子测序.运用Mothur等软件分析阳性克隆子序列,确定9条差异序列,为不同的AMF序列.[结果]克隆文库的Coverage C值为93.3％,克隆文库的Shannon-Wiener指数为2.079,Simpson指数为0.87,且Rarefaction曲线比较饱和.9个序列分为了两个不同的类群,代表不同AMF种类;球囊霉属(Glomus)是枇杷根系的主要AMF类群,OUT1和OTU2代表了文库中的主要类型,其中OTU1为根内根生囊霉(Rhizophagus irregularis);OTU3、OTU4、OTU5和OTU6代表着文库中的常见类型;其余序列则为枇杷根系中的少见或稀有AMF类型.[结论]球囊霉属(Glomus)是枇杷根系的主要AMF类型,其中根内根生囊霉(Rhizophagus irregularis)为优势AMF种类.
枇杷、AMF、克隆文库、18S rRNA基因、系统发育分析
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S667.3(果树园艺)
云南省都市特色农业工程技术研究中心项目TSNY0201;云南省教育厅科学研究基金项目2014Y390;云南省应用基础研究青年项目2013FD040;云南省应用基础研究自筹项目2013FZ099;昆明学院人才引进项目YJL14005;昆明学院人才引进基金项目YJL12010;昆明学院校立重点基金项目XJL12020;昆明学院大学生科研项目XJD16081;云南中烟品牌省内原料产地生态与主栽品种合理布局研究项目;云南省高校优势特色重点学科生态学建设项目资助05000511311;昆明市农业局滇池流域农业面源污染综合防控对策研究2016JC01;云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金项目GXKJ201623
2017-07-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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