基于高通量测序分析大花杓兰根际土壤细菌多样性

摘要：

[目的]从分子水平上对珍稀濒危药用植物大花杓兰根际土壤细菌群落多样性进行初步探讨.[方法]通过Illumina Miseq高通量测序技术对大花杓兰根际土壤细菌16S rRNA基因的V3～V4高变区片段进行测序,而后进行生物信息学分析.[结果]共得到166,847条16S rRNA基因序列.基于≥97％的相似度水平,通过聚类共获得1549个可操作分类单元(operational taxonomicunits,OTUs).大花杓兰根际土壤细菌在门、纲、目、科和属分类水平上的优势类群分别为变形菌门Proteobacteria (39.67％)、α-变形菌纲α-Proteobacteria (24.72％)、根瘤菌目Rhizobiales(11.11％)、鞘脂单胞菌科Sphingomonadaceae(7.13％)和鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas (6.27％).[结论]首次揭示了大花杓兰根际土壤细菌群落的多样性,为进一步探究大花杓兰与其根际细菌的相互关系以及大花杓兰的迁地保育奠定了基础.

关键词：大花杓兰、根际细菌、细菌多样性、高通量测序

所属期刊栏目：30

分类号：Q938.1(微生物学)

资助基金：河北省教育厅青年拔尖人才项目BJ2016045;廊坊师范学院博士基金项目LSLB201405;廊坊师范人才引进科研启动项目0140102001;廊坊师范学院微生物学重点学科项目2015001

在线出版日期：2017-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：811-816