桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析

摘要：

为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用.利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析.结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族基因,分布于桃的5条染色体上.MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CBL蛋白均含有4个保守的EF结构域.进化树分析表明CBLs可分为4个亚家族.TMHMM 2.0Server分析显示仅PpCBL1含有1个跨膜区.PlantsPFeatureScan分析显示PpCBL2、3和5均含有1个N-豆蔻酰化位点.NetPhos 2.0 Server结果显示PpCBLs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点.以上结果将为今后揭示桃CBL的功能提供重要的理论基础.

关键词：钙调磷酸酶B类似蛋白、桃、基因家族、进化分析、序列特征

所属期刊栏目：30

分类号：S662.1(果树园艺)

资助基金：北京市农林科学院青年科研基金项目QNJJ201416;北京市科技计划Z151100001015005;北京市农林科学院科技创新能力建设专项KJCX20140202

在线出版日期：2017-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：511-516