基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析

摘要：

本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes.将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes.KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类.KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个.SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46 440个含有SSR序列.这些信息为茶树不育基因筛选、不育机理研究以及分子标记开发奠定了基础.

关键词：茶树、转录组测序、不育基因、分子标记

所属期刊栏目：29

分类号：S571.1

资助基金：国家自然科学基金项目31460216;云南省重点专项2013BB006;云南省人才培养计划2015HB105;茶树生物学与资源利用国家重点实验室开放基金SKLTOF20150105

在线出版日期：2016-11-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2058-2062