类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析

摘要：

OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsH-MA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域.对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息.OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471 bp的编码序列内发现了6个变异位点;Tajima's D检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变异,而第457位的变异使得5个供试材料(1个0.ni-vara,4个ARO品种和1个粳稻品种)由于提前形成终止子在C末端少3个氨基酸,ARO类品种在此位点上与TRJ、IND、TEJ存在显著差异,这暗示ARO类品种可能由O.nivara演化而来.

关键词：亚洲栽培稻、野生稻、OsHMA2-like基因、进化

所属期刊栏目：29

分类号：S511(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金“抗稻瘟病基因Pid2进化与专化抗性分子机制研究”31360331;科技部基础性工作专项“贵州农业生物资源调查”2012FY110200;云南省自然科学基金“云南地方稻种Pi-d2同源基因序列及专化抗性分子机制研究”2013FZ146

在线出版日期：2016-11-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2009-2015