基于Illumina高通量测序的岩原鲤转录组分析

摘要：

为获得岩原鲤转录组信息,发掘功能基因,本研究采用Illumina高通量测序技术对岩原鲤全组织转录组进行测序.结果获得64 257 918个EST序列,经拼接和组装得到83 252条单基因序列(unigene),平均长度787 bp,长度范围201 ～ 16 572 bp.利用NCBI的蛋白质非冗余数据库(Nr)对所有unigene进行相似性搜索,共有37 157条unigene(44.63％)与数据库中的已知序列同源.利用Blast2GO v2.5软件对unigene进行注释,共得到29 919条(35.93％)注释基因,根据GO功能分类将其分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类56亚类.经KOG注释及分类,共有17 869条(21.49％)unigene成功注释到真校直系同源组中,并将其分为26个功能组分.经KEGG代谢通路分析可分为5大类(细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、代谢和有机系统)32小类共267个代谢通路.本研究通过高通量测序技术,对岩原鲤转录组进行测序,获得了大量的转录组信息,为岩原鲤功能基因克隆及基因组学研究提供了基础.

关键词：高通量测序、岩原鲤、转录组

所属期刊栏目：29

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：岩原鲤种质资源的分子遗传学研究2013GXJS-010

在线出版日期：2016-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1743-1749