甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析

摘要：

以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR扩增细胞色素b6-f复合体铁硫亚基基因的cDNA,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况.结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为796 bp,包括1个579 bp的开放阅读框,编码192个氨基酸.甘蔗与高粱CYT基因cDNA序列的同源性为94.0％,氨基酸序列同源性为99.0％;该基因推导的蛋白分子量大小为20.67KD,等电点为6.24,疏水性分值在0.50 ～2.11;蛋白二级结构中α-螺旋占17.19％,随机卷曲占53.12％,延伸链占21.53％,β-转角只占8.33％,GenBank登录号为JQ712582.实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,SoCYT基因表达均呈下降的趋势,PEG与PEG加Si处理的SoCYT基因的表达量有显著差异,加硅可减缓SoCY7基因表达的下降速度和对细胞色素b6/f复合体的结构的损伤和影响.

关键词：甘蔗、细胞色素b6-f复合体铁硫亚基、克隆、生物信息学分析、表达

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分类号：S566.1(经济作物)

资助基金：国家高技术研究计划863计划项目2013AA102604;科技部国际合作项目2013DFA31600;广西自然科学基金项目2014GXNSFBA118139;广西农业科学院基本业务专项项目桂农2014YD13

在线出版日期：2016-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1032-1037