梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析

摘要：

以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析.获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为DfUGP(Genebank:KJ525752).测序结果显示该序列全长1561 bp,包含一个完整的ORF框,长度为1422bp,编码473个氨基酸.梁山慈竹UGP基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,编码的蛋白结构较为相似,均合有N端区域、中心区域和C端区域,且蛋白三级结构中都具有NB-loop环和1-loop环.DfUGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90～379氨基酸,证明DfUGP属于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族.

关键词：梁山慈竹、UGP、克隆、生物信息学

所属期刊栏目：29

分类号：S795.504(森林树种)

资助基金：国家自然科学基金青年基金项目31400257,31400333;四川省“十二五”重点公关资助项目2011YZGG-10;四川省应用基础研究基金资助项目2013JY0182;四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心基金资助12zxsk07,13zxsk01

在线出版日期：2016-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：498-502