应用克隆文库构建法研究番茄根系AMF多样性

摘要：

从昆明学院种植基地随机采取番茄根系样品,CTAB法提取DNA,运用巢武PCR扩增目的片段,获得产物连接转化入大肠杆菌JM109构建AMF 18S rRNA部分基因克隆文库,随机挑选50个克隆子,从中排除6个假阳性,经ARDRA分析产生了13个差异图谱,测序分析最终确定11个AMF序列.结果表明:文库的Coverage C值高达95.2％,且Rarefaction曲线亦趋于饱和;11个序列与免培养的Glomus属克隆序列相似度较高,代表了本属的不同AMF种类;其中seq1和seq9所代表的地表球囊霉Glomus versiforme和摩西球囊霉Glomus mosseae是便染番茄根系的优势AMF类型;seq3、seq10和seq11均与Glomus属免培养克隆子聚集在一起;而seq2、seq4、seq5、seq6、seq7和seq8间亲缘关系较近,共同聚集在一个分支上.

关键词：AMF、18S rDNA、Nested-PCR、系统发育分析

所属期刊栏目：28

分类号：S641.2

资助基金：云南省应用基础研究自筹经费项目2013FZ099;昆明学院人才引进项目YJL12002;云南省高校都市型现代农业工程研究中心科研项目DS-C201402

在线出版日期：2015-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：323-328