4种大戟科植物HMGS基因家族的全基因组鉴定与分析

摘要：

3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A合酶(HMGS)是甲羟戊酸(MVA)代谢途径中的关键酶,催化乙酰-CoA和乙酰乙酰-CoA缩合形成戊二酸单酰辅酶A (HMG-CoA).研究基于蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树已释放的基因组和EST数据,对这4种大戟科植物的HMGS基因进行了系统鉴定,并在此基础上分析了其基因结构与进化关系.结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有1、1、2和2个HMGS基因,所有基因均包含11个内含子.同源分析表明,HMGS广泛存在于各种古细菌、真细菌和真核生物中,显示出较早的起源.在大多基因组已测序的绿色植物中,HMGS主要以单拷贝的形式存在,其中包括团藻、拟南芥、蓖麻和麻疯树,但在木薯和橡胶树中基因出现了加倍现象,这与小立碗藓、水稻和杨树类似.基因表达谱分析显示,在蓖麻的叶片、花、Ⅱ/ⅢⅡ期胚乳、Ⅴ/Ⅵ期胚乳和种子等组织中,RcHMGS在花和Ⅱ/Ⅲ期胚乳中的表达丰度较高,Ⅴ/Ⅵ期胚乳和叶片中次之,种子中最低.

关键词：大戟科植物、全基因组、HMCS基因家族

所属期刊栏目：27

分类号：S567.9(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31371556;海南省自然科学基金项目312026

在线出版日期：2015-03-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2259-2266