高粱SAMDC基因的电子克隆与生物信息学分析
以小麦S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)cDNA序列为信息探针,基于高粱EST数据库,通过电子克隆技术获得一个全长为2088 bp的高粱SAMDC基因.采用生物信息学方法对其开放读码框、理化性质、二级结构、结构域等进行分析.结果表明:此contig片段包含一个长达1197 bp的完整开放读框,编码398个氨基酸,分子量为43 246.0 KD,理论等电点为4.88;二级结构主要构件为无规则卷曲,结构功能域属于S-腺苷甲硫氨酸超家族.同源性分析表明,高粱SAMDC基因编码的蛋白与甘蔗SAMDC基因编码的蛋白同源性达94%.以上研究结果为进一步克隆该基因及功能验证奠定了基础.
电子克隆、高粱、SAMDC基因、生物信息学
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S514(禾谷类作物)
牡丹江师范学院青年学术骨干项目G201210
2014-06-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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