水稻航天诱变突变体全基因组测序研究

摘要：

将航天诱交突变体和野生型水稻材料进行全基因组测定,以已经完成全基因组测定的籼型水稻9311基因组序列为对照,利用SOAPsnp、SOAPindel和SOAPsv软件对序列进行SNP、InDel和SV等分析.结果发现野生型中出现SNPs 348966个,插入缺失片段(1～5 bp)62 298个,结构变异9962个;突变体材料中出现SNPs452173个,插入缺失片段(1～5 bp)66 977个,结构变异10336个.分析表明航天诱变因子对水稻基因组的诱变作用基本上平均分布,它与各对染色体的大小呈正相关.突变体中发生的诱变类型是SNPs＞ InDel＞ SV,表明航天诱变因子对水稻基因组中单碱基的改变为主要因素.本研究为探索航天诱变规律和更全面利用突交体资源奠定基础,为水稻功能基因研究和杂交水稻新资源的利用作出贡献.

关键词：突变体、野生型、全基因组测定、SNP、InDel、SV

所属期刊栏目：27

分类号：S511(禾谷类作物)

资助基金：水稻航天生物育种关键技术新品种选育研究

在线出版日期：2014-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：469-475