黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析

摘要：

本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经罴斑病菌诱导12、24、36、48、60h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库.随机挑取103个cDNA克隆进行5端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ES-Ts,利用tblastx对87个序列在NCBI数据库中进行同源性比对.结果表明,在编号为14的EST中找到了“蔷薇”黑斑抗性muRdr1基因位点,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr 1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1共9个基因.另外有2类基因的含量较高,一类是紫薯组织特异性相关基因,另一类是紫薯受干旱胁迫的抗逆相关基因.构建cDNA文库,应用EST技术并结合生物信息学技术,对紫薯抗病相关基因的表达分析,从基因水平上来研究紫薯抗病机制,为今后的紫薯抗病遗传育种及抗病机理奠定论基础.

关键词：紫薯、黑斑病菌诱导、抑制差减杂交技术、表达序列标签

所属期刊栏目：27

分类号：S435.311(病虫害及其防治)

资助基金：成都市科技计划项目11DXYB238NC-027

在线出版日期：2014-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：53-58