菊芋SSR-PCR反应体系优化及3个品种的分子鉴别

摘要：

本研究通过单因子优化试验和L16 (45)正交试验设计的方法,对菊芋SSR-PCR反应体系进行优化.结果表明,20ul最佳反应体系:10×PCR扩增缓冲液,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30 μmol/L正反引物,0.2 U Taq DNA聚合酶和50 ng模板DNA.利用该优化体系,从100个SSR引物组合中筛选出12个清晰且多态性高的引物组合对3个品种的菊芋DNA序列进行扩增,得到58个位点,其中多态性位点39个,多态率为67.2％;建立3个菊芋品种分子识别卡,用2对引物组合的6个多态性位点即可将其分开.本研究为后续应用SSR分子标记技术对菊芋进行种质资源分子遗传学方面的研究提供依据.

关键词：菊芋、SSR-PCR、优化、引物筛选、分子鉴别

所属期刊栏目：26

分类号：S632.3(蔬菜园艺)

资助基金：国家大宗蔬菜产业技术体系西宁综合试验站CARS-25-G-49;青海省蔬菜遗传与生理重点实验室创新基金Sc-zdsys-2011-02

在线出版日期：2014-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2441-2446